Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou2f1P25425 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms