Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd247P24161 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd247P24161 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd247P24161 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd247P24161 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd247P24161 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd247P24161 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd247P24161 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd247P24161 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd247P24161 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd247P24161 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd247P24161 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd247P24161 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms