Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tsta3P23591 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tsta3P23591 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tsta3P23591 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tsta3P23591 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tsta3P23591 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tsta3P23591 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tsta3P23591 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsta3P23591 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsta3P23591 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsta3P23591 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsta3P23591 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsta3P23591 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsta3P23591 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsta3P23591 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsta3P23591 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsta3P23591 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsta3P23591 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsta3P23591 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsta3P23591 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms