Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RarbP22605 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RarbP22605 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RarbP22605 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RarbP22605 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RarbP22605 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RarbP22605 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RarbP22605 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RarbP22605 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RarbP22605 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RarbP22605 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RarbP22605 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RarbP22605 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RarbP22605 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RarbP22605 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RarbP22605 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RarbP22605 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RarbP22605 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RarbP22605 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RarbP22605 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RarbP22605 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RarbP22605 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RarbP22605 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RarbP22605 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RarbP22605 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RarbP22605 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RarbP22605 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RarbP22605 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RarbP22605 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RarbP22605 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RarbP22605 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RarbP22605 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RarbP22605 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RarbP22605 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RarbP22605 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RarbP22605 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RarbP22605 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RarbP22605 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RarbP22605 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RarbP22605 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RarbP22605 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RarbP22605 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RarbP22605 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RarbP22605 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RarbP22605 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RarbP22605 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RarbP22605 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RarbP22605 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RarbP22605 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RarbP22605 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RarbP22605 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RarbP22605 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RarbP22605 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RarbP22605 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RarbP22605 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RarbP22605 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RarbP22605 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RarbP22605 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RarbP22605 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RarbP22605 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RarbP22605 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RarbP22605 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RarbP22605 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RarbP22605 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RarbP22605 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RarbP22605 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RarbP22605 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RarbP22605 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RarbP22605 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RarbP22605 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RarbP22605 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RarbP22605 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RarbP22605 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RarbP22605 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RarbP22605 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RarbP22605 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RarbP22605 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RarbP22605 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RarbP22605 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RarbP22605 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RarbP22605 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RarbP22605 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RarbP22605 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RarbP22605 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RarbP22605 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RarbP22605 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RarbP22605 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RarbP22605 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RarbP22605 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RarbP22605 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RarbP22605 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RarbP22605 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RarbP22605 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RarbP22605 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RarbP22605 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RarbP22605 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RarbP22605 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RarbP22605 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RarbP22605 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RarbP22605 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms