Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NefhP19246 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NefhP19246 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NefhP19246 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NefhP19246 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NefhP19246 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NefhP19246 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NefhP19246 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NefhP19246 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NefhP19246 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefhP19246 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefhP19246 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefhP19246 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefhP19246 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefhP19246 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefhP19246 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefhP19246 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefhP19246 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefhP19246 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefhP19246 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefhP19246 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NefhP19246 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NefhP19246 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NefhP19246 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NefhP19246 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NefhP19246 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NefhP19246 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NefhP19246 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NefhP19246 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NefhP19246 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NefhP19246 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NefhP19246 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NefhP19246 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NefhP19246 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NefhP19246 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NefhP19246 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NefhP19246 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NefhP19246 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NefhP19246 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefhP19246 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefhP19246 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefhP19246 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefhP19246 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefhP19246 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefhP19246 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefhP19246 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefhP19246 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NefhP19246 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefhP19246 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefhP19246 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefhP19246 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefhP19246 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefhP19246 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefhP19246 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefhP19246 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefhP19246 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefhP19246 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefhP19246 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NefhP19246 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefhP19246 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefhP19246 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefhP19246 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NefhP19246 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefhP19246 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefhP19246 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefhP19246 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefhP19246 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefhP19246 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefhP19246 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NefhP19246 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefhP19246 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefhP19246 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefhP19246 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NefhP19246 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefhP19246 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefhP19246 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefhP19246 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefhP19246 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefhP19246 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefhP19246 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefhP19246 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefhP19246 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefhP19246 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefhP19246 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NefhP19246 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NefhP19246 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NefhP19246 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NefhP19246 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NefhP19246 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NefhP19246 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NefhP19246 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NefhP19246 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NefhP19246 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NefhP19246 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NefhP19246 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NefhP19246 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NefhP19246 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NefhP19246 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NefhP19246 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefhP19246 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms