Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18528 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18528 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18528 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18528 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18528 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18528 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18528 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18528 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18528 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18528 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P18528 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18528 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18528 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18528 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P18528 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18528 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18528 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18528 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18528 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18528 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18528 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18528 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18528 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18528 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18528 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18528 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18528 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18528 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P18528 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P18528 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P18528 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P18528 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P18528 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18528 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18528 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18528 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18528 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P18528 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18528 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18528 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18528 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18528 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18528 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18528 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18528 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18528 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18528 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18528 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18528 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18528 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18528 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18528 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18528 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18528 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18528 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18528 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18528 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18528 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18528 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18528 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18528 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18528 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18528 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P18528 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18528 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18528 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18528 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18528 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18528 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18528 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18528 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18528 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18528 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18528 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18528 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18528 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18528 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18528 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18528 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18528 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18528 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18528 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18528 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18528 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18528 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18528 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18528 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18528 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18528 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18528 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P18528 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18528 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18528 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18528 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18528 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18528 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18528 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18528 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18528 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms