Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcna1P16388 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcna1P16388 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms