Protein–RNA interactions for Protein: P16125

Ldhb, L-lactate dehydrogenase B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhbP16125 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LdhbP16125 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LdhbP16125 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LdhbP16125 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LdhbP16125 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LdhbP16125 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LdhbP16125 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LdhbP16125 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LdhbP16125 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LdhbP16125 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LdhbP16125 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms