Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkceP16054 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkceP16054 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkceP16054 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkceP16054 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkceP16054 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkceP16054 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkceP16054 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkceP16054 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkceP16054 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkceP16054 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkceP16054 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkceP16054 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkceP16054 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkceP16054 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms