Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a1P12813 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms