Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calb1P12658 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calb1P12658 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calb1P12658 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Calb1P12658 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Calb1P12658 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Calb1P12658 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Calb1P12658 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calb1P12658 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calb1P12658 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calb1P12658 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms