Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamp1P11438 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamp1P11438 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamp1P11438 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamp1P11438 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamp1P11438 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamp1P11438 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamp1P11438 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamp1P11438 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamp1P11438 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamp1P11438 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamp1P11438 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamp1P11438 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamp1P11438 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamp1P11438 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamp1P11438 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamp1P11438 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamp1P11438 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamp1P11438 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms