Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl2P10889 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl2P10889 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl2P10889 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl2P10889 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl2P10889 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl2P10889 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl2P10889 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl2P10889 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl2P10889 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl2P10889 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl2P10889 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl2P10889 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl2P10889 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl2P10889 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl2P10889 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl2P10889 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl2P10889 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl2P10889 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl2P10889 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl2P10889 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl2P10889 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms