Protein–RNA interactions for Protein: P10711

Tcea1, Transcription elongation factor A protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea1P10711 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcea1P10711 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcea1P10711 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms