Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Amd1P0DMN7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amd1P0DMN7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms