Protein–RNA interactions for Protein: P06683

C9, Complement component C9, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P06683 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9P06683 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9P06683 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9P06683 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9P06683 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9P06683 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9P06683 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9P06683 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9P06683 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9P06683 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9P06683 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9P06683 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9P06683 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9P06683 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9P06683 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9P06683 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9P06683 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9P06683 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9P06683 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9P06683 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9P06683 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9P06683 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9P06683 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9P06683 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9P06683 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9P06683 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9P06683 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9P06683 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C9P06683 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9P06683 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9P06683 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9P06683 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9P06683 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9P06683 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9P06683 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C9P06683 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9P06683 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9P06683 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9P06683 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9P06683 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9P06683 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C9P06683 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9P06683 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9P06683 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9P06683 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9P06683 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9P06683 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9P06683 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9P06683 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9P06683 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9P06683 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9P06683 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9P06683 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C9P06683 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9P06683 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9P06683 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9P06683 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9P06683 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9P06683 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9P06683 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9P06683 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9P06683 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9P06683 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9P06683 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9P06683 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9P06683 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9P06683 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9P06683 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9P06683 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C9P06683 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9P06683 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9P06683 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9P06683 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9P06683 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9P06683 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9P06683 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9P06683 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9P06683 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9P06683 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9P06683 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9P06683 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9P06683 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9P06683 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9P06683 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9P06683 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9P06683 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9P06683 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9P06683 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9P06683 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9P06683 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9P06683 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9P06683 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9P06683 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9P06683 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9P06683 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C9P06683 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9P06683 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9P06683 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C9P06683 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9P06683 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms