Protein–RNA interactions for Protein: P01809

Ig heavy chain V region X24, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01809 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01809 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01809 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01809 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01809 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01809 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01809 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P01809 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01809 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01809 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01809 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01809 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01809 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P01809 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01809 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01809 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01809 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01809 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01809 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01809 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01809 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01809 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01809 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01809 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01809 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01809 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01809 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01809 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01809 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01809 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01809 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01809 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01809 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01809 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01809 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01809 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01809 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01809 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01809 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01809 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01809 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01809 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01809 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01809 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01809 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01809 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01809 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01809 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01809 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01809 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01809 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01809 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01809 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01809 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01809 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01809 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01809 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01809 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01809 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01809 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01809 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01809 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01809 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01809 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01809 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01809 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01809 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01809 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01809 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01809 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01809 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01809 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01809 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01809 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01809 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01809 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01809 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01809 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01809 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01809 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01809 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01809 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01809 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01809 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01809 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01809 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01809 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01809 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01809 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01809 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01809 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01809 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01809 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01809 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01809 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01809 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01809 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01809 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01809 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01809 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms