Protein–RNA interactions for Protein: P01724

Ig lambda-1 chain V regions MOPC 104E/RPC20/J558/S104, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01724 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01724 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01724 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01724 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01724 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01724 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01724 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01724 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01724 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01724 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01724 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01724 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01724 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01724 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01724 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01724 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01724 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01724 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01724 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01724 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01724 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01724 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01724 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01724 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01724 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01724 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01724 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01724 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01724 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01724 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01724 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01724 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01724 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01724 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01724 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01724 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01724 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01724 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01724 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01724 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01724 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01724 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01724 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01724 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01724 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01724 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01724 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01724 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01724 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01724 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01724 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01724 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01724 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01724 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01724 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01724 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01724 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01724 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01724 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01724 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01724 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01724 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01724 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01724 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01724 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01724 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01724 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01724 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01724 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01724 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01724 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01724 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01724 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01724 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01724 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01724 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01724 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01724 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01724 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01724 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01724 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01724 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01724 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01724 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01724 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01724 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01724 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01724 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01724 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01724 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01724 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01724 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01724 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01724 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01724 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01724 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01724 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01724 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01724 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01724 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms