Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ifnb1P01575 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms