Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MscO88940 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MscO88940 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MscO88940 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MscO88940 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MscO88940 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MscO88940 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MscO88940 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MscO88940 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MscO88940 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MscO88940 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MscO88940 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MscO88940 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MscO88940 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MscO88940 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MscO88940 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MscO88940 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MscO88940 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MscO88940 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MscO88940 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MscO88940 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MscO88940 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MscO88940 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MscO88940 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MscO88940 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MscO88940 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MscO88940 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MscO88940 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MscO88940 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MscO88940 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MscO88940 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MscO88940 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MscO88940 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MscO88940 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MscO88940 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MscO88940 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MscO88940 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MscO88940 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MscO88940 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MscO88940 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MscO88940 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MscO88940 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MscO88940 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MscO88940 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MscO88940 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MscO88940 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MscO88940 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MscO88940 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MscO88940 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MscO88940 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MscO88940 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MscO88940 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MscO88940 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MscO88940 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MscO88940 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MscO88940 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MscO88940 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MscO88940 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MscO88940 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MscO88940 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MscO88940 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MscO88940 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MscO88940 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MscO88940 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MscO88940 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MscO88940 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MscO88940 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MscO88940 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MscO88940 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MscO88940 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MscO88940 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MscO88940 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MscO88940 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MscO88940 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MscO88940 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MscO88940 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MscO88940 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MscO88940 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MscO88940 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MscO88940 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MscO88940 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MscO88940 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MscO88940 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MscO88940 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MscO88940 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MscO88940 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MscO88940 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MscO88940 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MscO88940 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MscO88940 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MscO88940 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MscO88940 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MscO88940 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MscO88940 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MscO88940 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MscO88940 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MscO88940 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MscO88940 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MscO88940 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MscO88940 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms