Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tom1O88746 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tom1O88746 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tom1O88746 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tom1O88746 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tom1O88746 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tom1O88746 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tom1O88746 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tom1O88746 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tom1O88746 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tom1O88746 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tom1O88746 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tom1O88746 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tom1O88746 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tom1O88746 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms