Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sorl1O88307 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sorl1O88307 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sorl1O88307 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sorl1O88307 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sorl1O88307 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sorl1O88307 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sorl1O88307 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sorl1O88307 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sorl1O88307 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sorl1O88307 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sorl1O88307 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sorl1O88307 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sorl1O88307 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sorl1O88307 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sorl1O88307 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sorl1O88307 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sorl1O88307 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sorl1O88307 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sorl1O88307 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sorl1O88307 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sorl1O88307 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sorl1O88307 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sorl1O88307 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sorl1O88307 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sorl1O88307 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sorl1O88307 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sorl1O88307 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sorl1O88307 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sorl1O88307 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sorl1O88307 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sorl1O88307 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sorl1O88307 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Sorl1O88307 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sorl1O88307 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sorl1O88307 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sorl1O88307 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sorl1O88307 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sorl1O88307 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sorl1O88307 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sorl1O88307 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sorl1O88307 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sorl1O88307 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sorl1O88307 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sorl1O88307 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sorl1O88307 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sorl1O88307 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sorl1O88307 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sorl1O88307 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sorl1O88307 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sorl1O88307 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sorl1O88307 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sorl1O88307 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sorl1O88307 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sorl1O88307 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sorl1O88307 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sorl1O88307 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sorl1O88307 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sorl1O88307 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sorl1O88307 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sorl1O88307 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sorl1O88307 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sorl1O88307 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sorl1O88307 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sorl1O88307 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sorl1O88307 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sorl1O88307 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sorl1O88307 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sorl1O88307 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sorl1O88307 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sorl1O88307 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sorl1O88307 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sorl1O88307 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sorl1O88307 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sorl1O88307 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sorl1O88307 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sorl1O88307 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sorl1O88307 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sorl1O88307 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sorl1O88307 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sorl1O88307 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sorl1O88307 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sorl1O88307 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sorl1O88307 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sorl1O88307 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sorl1O88307 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sorl1O88307 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sorl1O88307 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sorl1O88307 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sorl1O88307 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sorl1O88307 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sorl1O88307 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sorl1O88307 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sorl1O88307 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sorl1O88307 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sorl1O88307 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sorl1O88307 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sorl1O88307 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sorl1O88307 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sorl1O88307 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms