Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf5O70191 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf5O70191 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf5O70191 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf5O70191 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf5O70191 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf5O70191 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf5O70191 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf5O70191 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf5O70191 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf5O70191 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf5O70191 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf5O70191 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf5O70191 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf5O70191 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf5O70191 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf5O70191 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf5O70191 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf5O70191 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf5O70191 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atf5O70191 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atf5O70191 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atf5O70191 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atf5O70191 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Atf5O70191 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atf5O70191 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atf5O70191 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf5O70191 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf5O70191 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atf5O70191 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Atf5O70191 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atf5O70191 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atf5O70191 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atf5O70191 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atf5O70191 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atf5O70191 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atf5O70191 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atf5O70191 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atf5O70191 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atf5O70191 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Atf5O70191 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atf5O70191 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms