Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtogO55225 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtogO55225 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtogO55225 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtogO55225 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtogO55225 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtogO55225 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtogO55225 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtogO55225 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtogO55225 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtogO55225 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtogO55225 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtogO55225 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtogO55225 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
OtogO55225 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtogO55225 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtogO55225 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtogO55225 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtogO55225 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtogO55225 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtogO55225 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtogO55225 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtogO55225 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtogO55225 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtogO55225 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtogO55225 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtogO55225 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtogO55225 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtogO55225 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtogO55225 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
OtogO55225 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtogO55225 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtogO55225 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtogO55225 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtogO55225 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtogO55225 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtogO55225 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtogO55225 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
OtogO55225 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtogO55225 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtogO55225 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtogO55225 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtogO55225 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtogO55225 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtogO55225 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtogO55225 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtogO55225 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtogO55225 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtogO55225 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
OtogO55225 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtogO55225 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtogO55225 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtogO55225 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtogO55225 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtogO55225 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtogO55225 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtogO55225 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtogO55225 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtogO55225 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtogO55225 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtogO55225 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtogO55225 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtogO55225 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtogO55225 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtogO55225 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtogO55225 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OtogO55225 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtogO55225 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtogO55225 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtogO55225 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtogO55225 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtogO55225 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtogO55225 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OtogO55225 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtogO55225 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtogO55225 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OtogO55225 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OtogO55225 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtogO55225 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtogO55225 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtogO55225 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtogO55225 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
OtogO55225 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtogO55225 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
OtogO55225 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtogO55225 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtogO55225 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtogO55225 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtogO55225 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtogO55225 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtogO55225 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtogO55225 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtogO55225 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtogO55225 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtogO55225 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
OtogO55225 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtogO55225 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtogO55225 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtogO55225 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtogO55225 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms