Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms