Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pole2O54956 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole2O54956 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pole2O54956 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pole2O54956 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pole2O54956 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole2O54956 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole2O54956 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pole2O54956 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pole2O54956 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms