Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NlkO54949 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NlkO54949 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NlkO54949 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NlkO54949 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NlkO54949 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NlkO54949 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NlkO54949 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NlkO54949 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NlkO54949 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NlkO54949 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NlkO54949 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NlkO54949 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NlkO54949 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NlkO54949 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NlkO54949 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NlkO54949 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NlkO54949 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NlkO54949 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NlkO54949 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NlkO54949 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NlkO54949 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NlkO54949 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NlkO54949 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NlkO54949 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NlkO54949 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NlkO54949 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NlkO54949 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NlkO54949 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NlkO54949 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NlkO54949 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NlkO54949 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NlkO54949 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NlkO54949 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NlkO54949 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NlkO54949 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NlkO54949 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NlkO54949 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NlkO54949 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NlkO54949 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NlkO54949 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NlkO54949 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NlkO54949 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NlkO54949 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NlkO54949 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NlkO54949 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NlkO54949 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NlkO54949 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NlkO54949 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NlkO54949 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NlkO54949 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NlkO54949 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NlkO54949 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NlkO54949 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NlkO54949 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NlkO54949 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NlkO54949 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NlkO54949 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NlkO54949 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NlkO54949 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NlkO54949 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NlkO54949 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NlkO54949 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NlkO54949 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NlkO54949 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NlkO54949 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NlkO54949 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NlkO54949 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NlkO54949 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NlkO54949 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NlkO54949 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NlkO54949 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NlkO54949 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NlkO54949 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NlkO54949 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NlkO54949 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NlkO54949 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NlkO54949 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NlkO54949 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NlkO54949 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NlkO54949 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NlkO54949 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NlkO54949 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NlkO54949 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NlkO54949 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NlkO54949 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NlkO54949 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NlkO54949 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NlkO54949 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NlkO54949 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NlkO54949 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NlkO54949 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NlkO54949 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NlkO54949 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NlkO54949 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NlkO54949 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NlkO54949 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NlkO54949 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NlkO54949 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NlkO54949 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms