Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf12O54907 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms