Protein–RNA interactions for Protein: O54824

Il16, Pro-interleukin-16, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il16O54824 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Il16O54824 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Il16O54824 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Il16O54824 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Il16O54824 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Il16O54824 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Il16O54824 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Il16O54824 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Il16O54824 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Il16O54824 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Il16O54824 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Il16O54824 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Il16O54824 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Il16O54824 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Il16O54824 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Il16O54824 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Il16O54824 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Il16O54824 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Il16O54824 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Il16O54824 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Il16O54824 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Il16O54824 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Il16O54824 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Il16O54824 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Il16O54824 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Il16O54824 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Il16O54824 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Il16O54824 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Il16O54824 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Il16O54824 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Il16O54824 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Il16O54824 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Il16O54824 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Il16O54824 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Il16O54824 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Il16O54824 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Il16O54824 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Il16O54824 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Il16O54824 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Il16O54824 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Il16O54824 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Il16O54824 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Il16O54824 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Il16O54824 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Il16O54824 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Il16O54824 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Il16O54824 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Il16O54824 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Il16O54824 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Il16O54824 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Il16O54824 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Il16O54824 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Il16O54824 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Il16O54824 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Il16O54824 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Il16O54824 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Il16O54824 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Il16O54824 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Il16O54824 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Il16O54824 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Il16O54824 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Il16O54824 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Il16O54824 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Il16O54824 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Il16O54824 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Il16O54824 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Il16O54824 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Il16O54824 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Il16O54824 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Il16O54824 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Il16O54824 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Il16O54824 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Il16O54824 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Il16O54824 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Il16O54824 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Il16O54824 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Il16O54824 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Il16O54824 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Il16O54824 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Il16O54824 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Il16O54824 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Il16O54824 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Il16O54824 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Il16O54824 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Il16O54824 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Il16O54824 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Il16O54824 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Il16O54824 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Il16O54824 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Il16O54824 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Il16O54824 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Il16O54824 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Il16O54824 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Il16O54824 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Il16O54824 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Il16O54824 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Il16O54824 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Il16O54824 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Il16O54824 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Il16O54824 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms