Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DffaO54786 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DffaO54786 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DffaO54786 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DffaO54786 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DffaO54786 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DffaO54786 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DffaO54786 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DffaO54786 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DffaO54786 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DffaO54786 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DffaO54786 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DffaO54786 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DffaO54786 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DffaO54786 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DffaO54786 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DffaO54786 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DffaO54786 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DffaO54786 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DffaO54786 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DffaO54786 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DffaO54786 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DffaO54786 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DffaO54786 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DffaO54786 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DffaO54786 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DffaO54786 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DffaO54786 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DffaO54786 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DffaO54786 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DffaO54786 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DffaO54786 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DffaO54786 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DffaO54786 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DffaO54786 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DffaO54786 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DffaO54786 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DffaO54786 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DffaO54786 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DffaO54786 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DffaO54786 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DffaO54786 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DffaO54786 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DffaO54786 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DffaO54786 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DffaO54786 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DffaO54786 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DffaO54786 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DffaO54786 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DffaO54786 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DffaO54786 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DffaO54786 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DffaO54786 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DffaO54786 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DffaO54786 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DffaO54786 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DffaO54786 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DffaO54786 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DffaO54786 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DffaO54786 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DffaO54786 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DffaO54786 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DffaO54786 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DffaO54786 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DffaO54786 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DffaO54786 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DffaO54786 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DffaO54786 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DffaO54786 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DffaO54786 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DffaO54786 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DffaO54786 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DffaO54786 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DffaO54786 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DffaO54786 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DffaO54786 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DffaO54786 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DffaO54786 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DffaO54786 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DffaO54786 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DffaO54786 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DffaO54786 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DffaO54786 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DffaO54786 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DffaO54786 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DffaO54786 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DffaO54786 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DffaO54786 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DffaO54786 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DffaO54786 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DffaO54786 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DffaO54786 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DffaO54786 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DffaO54786 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DffaO54786 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DffaO54786 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DffaO54786 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DffaO54786 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DffaO54786 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DffaO54786 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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