Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cops5O35864 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cops5O35864 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops5O35864 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops5O35864 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops5O35864 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops5O35864 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops5O35864 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops5O35864 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cops5O35864 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops5O35864 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops5O35864 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops5O35864 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms