Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NudcO35685 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NudcO35685 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NudcO35685 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NudcO35685 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NudcO35685 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NudcO35685 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NudcO35685 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NudcO35685 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NudcO35685 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NudcO35685 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NudcO35685 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NudcO35685 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NudcO35685 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NudcO35685 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NudcO35685 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NudcO35685 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NudcO35685 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NudcO35685 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NudcO35685 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NudcO35685 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NudcO35685 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NudcO35685 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NudcO35685 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NudcO35685 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NudcO35685 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NudcO35685 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NudcO35685 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NudcO35685 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NudcO35685 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NudcO35685 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NudcO35685 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NudcO35685 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NudcO35685 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NudcO35685 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NudcO35685 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NudcO35685 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NudcO35685 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NudcO35685 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NudcO35685 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NudcO35685 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NudcO35685 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NudcO35685 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NudcO35685 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NudcO35685 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NudcO35685 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NudcO35685 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NudcO35685 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NudcO35685 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NudcO35685 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NudcO35685 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NudcO35685 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NudcO35685 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NudcO35685 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NudcO35685 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NudcO35685 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NudcO35685 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NudcO35685 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NudcO35685 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NudcO35685 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NudcO35685 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NudcO35685 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NudcO35685 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NudcO35685 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NudcO35685 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NudcO35685 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NudcO35685 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NudcO35685 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NudcO35685 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NudcO35685 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NudcO35685 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NudcO35685 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NudcO35685 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NudcO35685 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NudcO35685 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NudcO35685 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NudcO35685 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NudcO35685 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NudcO35685 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NudcO35685 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NudcO35685 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NudcO35685 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NudcO35685 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NudcO35685 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NudcO35685 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NudcO35685 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NudcO35685 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NudcO35685 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NudcO35685 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NudcO35685 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NudcO35685 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NudcO35685 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NudcO35685 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NudcO35685 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NudcO35685 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NudcO35685 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NudcO35685 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NudcO35685 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NudcO35685 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NudcO35685 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms