Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx1aO35526 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms