Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt1O35449 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms