Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppef2O35385 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppef2O35385 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms