Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KeraO35367 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KeraO35367 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KeraO35367 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KeraO35367 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KeraO35367 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KeraO35367 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KeraO35367 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KeraO35367 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KeraO35367 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KeraO35367 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KeraO35367 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KeraO35367 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KeraO35367 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KeraO35367 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KeraO35367 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KeraO35367 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KeraO35367 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KeraO35367 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KeraO35367 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KeraO35367 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KeraO35367 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KeraO35367 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KeraO35367 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KeraO35367 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KeraO35367 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KeraO35367 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KeraO35367 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KeraO35367 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KeraO35367 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KeraO35367 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KeraO35367 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KeraO35367 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KeraO35367 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KeraO35367 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KeraO35367 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KeraO35367 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KeraO35367 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KeraO35367 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KeraO35367 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KeraO35367 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KeraO35367 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KeraO35367 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KeraO35367 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KeraO35367 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KeraO35367 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KeraO35367 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KeraO35367 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KeraO35367 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KeraO35367 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KeraO35367 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KeraO35367 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KeraO35367 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KeraO35367 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KeraO35367 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KeraO35367 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KeraO35367 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KeraO35367 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KeraO35367 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KeraO35367 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KeraO35367 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KeraO35367 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KeraO35367 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KeraO35367 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KeraO35367 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KeraO35367 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KeraO35367 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KeraO35367 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KeraO35367 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KeraO35367 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KeraO35367 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KeraO35367 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KeraO35367 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KeraO35367 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KeraO35367 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KeraO35367 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KeraO35367 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KeraO35367 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KeraO35367 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KeraO35367 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KeraO35367 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KeraO35367 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KeraO35367 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KeraO35367 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KeraO35367 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KeraO35367 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KeraO35367 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KeraO35367 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KeraO35367 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KeraO35367 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KeraO35367 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KeraO35367 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KeraO35367 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KeraO35367 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KeraO35367 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KeraO35367 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KeraO35367 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KeraO35367 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KeraO35367 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KeraO35367 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms