Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms