Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad6O35182 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad6O35182 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smad6O35182 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad6O35182 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad6O35182 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad6O35182 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad6O35182 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms