Protein–RNA interactions for Protein: O09116

Sprr3, Small proline-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr3O09116 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr3O09116 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sprr3O09116 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms