Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efna5O08543 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efna5O08543 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efna5O08543 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Efna5O08543 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna5O08543 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna5O08543 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efna5O08543 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Efna5O08543 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efna5O08543 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efna5O08543 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efna5O08543 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efna5O08543 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efna5O08543 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms