Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20939L7N243 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms