Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ32

A630076J17Rik, MCG1026332, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A630076J17RikJ3QQ32 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
A630076J17RikJ3QQ32 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A630076J17RikJ3QQ32 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms