Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccer2J3QPU5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccer2J3QPU5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms