Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lipo1J3QME6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lipo1J3QME6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms