Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930544D05RikJ3QK56 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930544D05RikJ3QK56 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms