Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU2

Gm21820, Predicted gene, 21820, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21820J3KMU2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm21820J3KMU2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21820J3KMU2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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