Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AK157302I3ITR1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AK157302I3ITR1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms