Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm29394H3BIW7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm29394H3BIW7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm29394H3BIW7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm29394H3BIW7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm29394H3BIW7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm29394H3BIW7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm29394H3BIW7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm29394H3BIW7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm29394H3BIW7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm29394H3BIW7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm29394H3BIW7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm29394H3BIW7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm29394H3BIW7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm29394H3BIW7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm29394H3BIW7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm29394H3BIW7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm29394H3BIW7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm29394H3BIW7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm29394H3BIW7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm29394H3BIW7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm29394H3BIW7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms