Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r67G5E8C1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r67G5E8C1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r67G5E8C1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r67G5E8C1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vmn1r67G5E8C1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r67G5E8C1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms