Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r34G3XA52 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r34G3XA52 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms